荧光显微镜是荧光显微检测的专用工具，它是光学显微镜的一种。它除了具有光学显微镜的基本结构和光学放大作用外，基于荧光的特性，还具备以下独特的功能要求:
　　1、提供足够能量的能激发出荧光的光源。
　　2、有着适应不同物质所需的激发光谱一组滤色片，从光源中选择合适的激发光谱，使析出的光谱与该物质的吸收光谱重合，以期望获得的荧光。
　　3、为获得较弱的荧光图像，还要建立一套截止滤色片，它使所需观察的荧光进入系统成像，而将其余的光波，包括发射光阻挡在外，用来提高图像的衬度。
　　4、放大的光学系统应适应荧光的特性，终获得既能观察又能摄影的高亮度、高分辨力的良好衬度的荧光图像。
　　5、仪器的安全性。应用汞灯要防止紫外线的泄漏和汞灯的爆炸，保证电器安全。